مطالب كتاب در چهار فصل تدوين شده است. در فصل نخست، آزادي انديشه از ديدگاه اسلام بررسي مي‌شود. فصل دوم درباره‌ي موانع و عوامل بازدارنده‌ي انديشه است. در فصل بعدي، پيامدهاي حصاربندي و تحديد آزادي انديشه و در فصل پاياني، بحثي تحت عنوان ضابطه‌مندي و معيارهاي حفظ آزادي انديشه مطرح مي‌شود.